Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSI1O43347 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSI1O43347 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSI1O43347 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSI1O43347 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSI1O43347 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI1O43347 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI1O43347 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI1O43347 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI1O43347 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI1O43347 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI1O43347 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI1O43347 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI1O43347 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSI1O43347 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms