Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMINO43313 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMINO43313 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMINO43313 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMINO43313 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMINO43313 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMINO43313 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMINO43313 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATMINO43313 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATMINO43313 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMINO43313 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMINO43313 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMINO43313 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMINO43313 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMINO43313 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMINO43313 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMINO43313 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMINO43313 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMINO43313 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMINO43313 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms