Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MSH5O43196 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MSH5O43196 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MSH5O43196 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MSH5O43196 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSH5O43196 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSH5O43196 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSH5O43196 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSH5O43196 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSH5O43196 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSH5O43196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSH5O43196 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MSH5O43196 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSH5O43196 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSH5O43196 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSH5O43196 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MSH5O43196 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSH5O43196 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSH5O43196 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSH5O43196 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms