Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRXO43186 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRXO43186 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRXO43186 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRXO43186 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRXO43186 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRXO43186 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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