Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.339e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.269e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.199e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-211ENST00000490644 681 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-226ENST00000565784 571 ntTSL 415.8■□□□□ 0.129e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-202ENST00000421803 1111 ntTSL 215.75■□□□□ 0.119e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-237ENST00000568374 569 ntTSL 415.75■□□□□ 0.119e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-214ENST00000563539 659 ntTSL 415.75■□□□□ 0.119e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-203ENST00000561615 568 ntTSL 415.29■□□□□ 0.049e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-206ENST00000562071 602 ntTSL 315.24■□□□□ 0.039e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-232ENST00000566256 580 ntTSL 414.95□□□□□ -0.029e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-241ENST00000569355 867 ntTSL 514.18□□□□□ -0.149e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.179e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-222ENST00000565534 1002 ntTSL 213.94□□□□□ -0.189e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 BTRC-201ENST00000370183 655 ntTSL 313.72□□□□□ -0.219e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 313.66□□□□□ -0.223e-7■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-205ENST00000459722 779 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 211.94□□□□□ -0.59e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ZFYVE27-210ENST00000477521 743 ntTSL 211.8□□□□□ -0.529e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-203ENST00000425011 338 ntTSL 311.31□□□□□ -0.61e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-210ENST00000481555 401 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-202ENST00000415568 959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.871e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-212ENST00000494801 1008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.881e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.011e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.259e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.349e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 411.51□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 SLC2A9-209ENST00000506839 446 ntTSL 312.24□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 SLC2A9-213ENST00000513129 738 ntTSL 39.97□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.675e-7■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.255e-7■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.28□□□□□ -1.566e-10■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 C7orf26-204ENST00000445375 675 ntTSL 518.65■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 C7orf26-203ENST00000440409 458 ntTSL 314.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 C7orf26-205ENST00000472693 1006 ntTSL 513.46□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 26.2
PRPF4O43172 COL9A3-211ENST00000477612 635 ntTSL 320.7■□□□□ 0.92e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 NDST1-202ENST00000518299 769 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.967e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.13■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 513.36□□□□□ -0.276e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 NFE2L1-212ENST00000581319 481 ntTSL 38.52□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 518.27■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ACSF3-206ENST00000537116 2496 ntTSL 213.08□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 26.1
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PRPF4O43172 ACSF3-205ENST00000535176 421 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.495e-7■■■■□ 26.1
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PRPF4O43172 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 214.06□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.145e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-204ENST00000519255 575 ntTSL 48.37□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.75e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-205ENST00000519277 747 ntTSL 34.18□□□□□ -1.745e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.825e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 UBE2W-202ENST00000422906 3903 ntTSL 1 (best)1.47□□□□□ -2.175e-6■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.536e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.986e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-211ENST00000600753 483 ntTSL 420.12■□□□□ 0.816e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 219.72■□□□□ 0.756e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 319.3■□□□□ 0.686e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 219.12■□□□□ 0.656e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.66e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-208ENST00000597808 570 ntTSL 217.04■□□□□ 0.326e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 ABCF2-206ENST00000477252 249 ntTSL 316.09■□□□□ 0.176e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-205ENST00000594144 723 ntTSL 314.21□□□□□ -0.136e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-206ENST00000594526 709 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 SAE1-210ENST00000600706 744 ntTSL 59.16□□□□□ -0.946e-8■■■■□ 26.1
PRPF4O43172 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.157e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.297e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.347e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.537e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.297e-11■■■■□ 26
PRPF4O43172 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 527.3■■□□□ 1.962e-7■■■■□ 26
PRPF4O43172 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)21.33■■□□□ 1.012e-7■■■■□ 26
PRPF4O43172 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.852e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-219ENST00000604165 582 ntTSL 519.77■□□□□ 0.762e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 517.61■□□□□ 0.412e-13■■■■□ 26
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