Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNN4O15554 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNN4O15554 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNN4O15554 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms