Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB6O15197 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms