Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PODXLO00592 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PODXLO00592 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PODXLO00592 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PODXLO00592 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PODXLO00592 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PODXLO00592 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PODXLO00592 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PODXLO00592 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PODXLO00592 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXLO00592 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXLO00592 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXLO00592 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PODXLO00592 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PODXLO00592 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PODXLO00592 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms