Protein–RNA interactions for Protein: O00444

PLK4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLK4O00444 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLK4O00444 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLK4O00444 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLK4O00444 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLK4O00444 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLK4O00444 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLK4O00444 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLK4O00444 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLK4O00444 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLK4O00444 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLK4O00444 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLK4O00444 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLK4O00444 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLK4O00444 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLK4O00444 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLK4O00444 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLK4O00444 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLK4O00444 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLK4O00444 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms