Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms