Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms