Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BM21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BM21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BM21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BM21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BM21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BM21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BM21 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BM21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BM21 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BM21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BM21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BM21 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BM21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BM21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BM21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BM21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BM21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BM21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BM21 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BM21 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BM21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BM21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms