Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
E9PCH4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
E9PCH4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
E9PCH4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
E9PCH4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
E9PCH4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
E9PCH4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
E9PCH4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
E9PCH4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
E9PCH4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
E9PCH4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
E9PCH4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
E9PCH4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
E9PCH4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
E9PCH4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
E9PCH4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
E9PCH4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
E9PCH4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
E9PCH4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
E9PCH4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
E9PCH4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
E9PCH4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
E9PCH4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
E9PCH4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
E9PCH4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
E9PCH4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
E9PCH4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
E9PCH4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
E9PCH4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
E9PCH4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
E9PCH4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
E9PCH4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
E9PCH4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
E9PCH4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms