Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PBE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PBE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PBE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PBE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PBE3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PBE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PBE3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms