Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms