Protein–RNA interactions for Protein: B4E1H0

SUPT3H, Transcription initiation protein SPT3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT3HB4E1H0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUPT3HB4E1H0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUPT3HB4E1H0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms