Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms