Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD1B0YJ81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD1B0YJ81 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms