Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO5BA8MYB1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms