Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERPINE3A8MV23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERPINE3A8MV23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms