Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM200CA6NKL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM200CA6NKL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms