Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIPT2A6NK58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms