Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WIPF3A6NGB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
WIPF3A6NGB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WIPF3A6NGB9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WIPF3A6NGB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms