Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf60A6NFR6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms