Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HELTA6NFD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms