Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms