Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms