Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC26A0AVF1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC26A0AVF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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