Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YYE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0J9YYE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0J9YYE9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.7 ms