Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A087X1B8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms