Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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