Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms