Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms