Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms