Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms