Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms