Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP8Q99708 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms