Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms