Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGBD4Q96DM1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGBD4Q96DM1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms