Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms