Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms