Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP61Q8NHU2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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