Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SEMA6DQ8NFY4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms