Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SCXQ7RTU7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms