Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC7AQ5VTJ3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms