Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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