Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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