Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms