Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMB3Q13751 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms