Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EP300Q09472 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms